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=== 條頓騎士團（1308年－1454年） ===
1308年11月13日，條頓騎士團征服了這座繁榮的城市，製造了格但斯克大屠殺。這次屠殺導致了該市的衰落，並引發了條頓騎士和波蘭之間一系列的戰爭，直到1343年簽訂和約，條頓騎士承認他們占領的波美拉尼亞是他們從波蘭國王那裡接受的「救濟」。儘管仍然存在一些法律方面關於領地財產歸屬權的爭議，但是這個協議最終確立了格但斯克在1343年成立了市政當局，並發展了波蘭經維斯瓦河進口糧食的貿易路線。

在條頓騎士控制的年代，這座城市的規模和貿易得到了恢復和發展，日耳曼人的影響也增加了。德語名稱「但澤」逐漸取代了該市的波蘭名稱「格但斯克」。1361年，但澤成為漢薩同盟成員之一，並成為漢薩同盟中普魯士和立窩尼亞商圈的首席城市，貿易範圍包括普魯士、波羅的海東岸的條頓騎士團領地、以及波蘭和瑞典。

1409年，條頓騎士團和波蘭之間又爆發了新的戰爭，這場戰爭結束於1410年的古倫瓦爾德之戰，該市大部分一度歸屬于波蘭國王直接管理。一年以後的1411年，托倫和約簽訂，但澤又回到條頓騎士的管理之下。1440年，但澤參與建立了普魯士邦聯。

1454年，接受波蘭保護的普魯士聯邦對1410年坦能堡戰役之後條頓騎士團的政策感到不滿，十三年戰爭（1454年－1466年）爆發。在戰爭中，這些城市依賴騎士團城堡進行戰鬥，奪取了托倫。波蘭國王面臨困境，聚集了一支軍隊，在柯尼茲戰役中又被擊敗。但是隨著戰事的開展，最終造成條頓騎士團在經濟上無法支撐。在戰爭的間歇，1457年5月25日，該市被併入「王室普魯士」 - 接受波蘭王國的保護，同時保持其自治市的獨立地位。這個海港首次獲得進入波蘭市場的特權，同時保持與漢薩同盟其他城市之間繁榮的貿易。1466年，條頓騎士團戰敗，波蘭與普魯士簽署了第二次托倫和約，條頓騎士團只保留了東普魯士的殘餘領土，但被迫效忠波蘭國王，成為波蘭的附庸國，稱為普魯士公國，並且被迫割讓包括但澤和馬林堡、埃爾布隆格和瓦爾米亞在內的普魯士西部。這些地區和前波莫瑞公國以及托倫一起，被稱為「王室普魯士」，在波蘭國王之下，但澤、托倫和埃爾布隆格三個共和政體的城市繼續享有在戰爭期間已經部分獲得的廣泛的政治、經濟和文化的內部自治權。其中包括1457年國王卡西米爾四世授予該市的所謂「非常榮幸」（Große Privileg）。

在1470年，為了備戰，該市裝備了漢薩同盟的第一艘大型卡拉維爾帆船，法國製造的「但澤的彼得」。

在1522年，改革新教牧師雅各·海格開始在格但斯克推行宗教改革。

1569年的盧布林聯盟威脅到格但斯克的自主權，在無數的衝突，格但斯克繼續聲稱自主。因此，1576年新國王斯特凡·巴托里宣布沒收但澤的權利，並把波蘭王國的貿易出入口，改設於埃爾布隆格——另一座港口都市。作為反擊，但澤與其同盟的丹麥海軍，輕易的擊敗了波蘭貧弱的艦隊，封鎖波蘭的港口，並暢通了但澤的海運。但是，巴托里的大軍仍持續從三面包圍但擇，這一圍就是六個多月。這樣的局面持續到隔年（1577年）四月，才因巴托里在會戰中大敗但澤陸軍而開創新局。雖然巴托里打算乘勝砲轟但澤市，但卻因但澤軍七月的突擊而毀掉了大半火砲。雙方最終於年底達成妥協：斯特凡·巴托里承認城市的特殊地位和獲前王承認的但澤法；但澤市承認他是波蘭的統治者，並支付了巨額賠款（共計200,000金古爾登）。但澤後來在波蘭與瑞典和沙俄交戰時，繼續保持對波蘭立陶宛聯邦的忠誠，並在聯邦需要的時候提供援助。

波蘭國會在1585年十一月26日修正城市法規之後，但澤正式成為聯邦中擁有最多特權的城市。